L’orgue fut commandé par l’évêque Michel II Poncet de La Rivière, le 1er Septembre 1679 pour la cathédrale d’Uzès.
La construction se termine fin 1683.
Le buffet est l’œuvre de Pierre Biscarrat de Pont Saint Esprit.
Deux ans plus tard, les volets de l’orgue furent peints par Jean Pouveille, maître-doreur de Montpellier, il a aussi peint et doré le buffet.
Cet orgue a traversé la révolution sans grand dommage, ce qui est incroyable.
Il a quand même besoin d’une restauration complète au XIXème siècle. Elle sera réalisée dans le goût romantique de l’époque, par la maison Daublaine et Callinet en 1844.
L’orgue que l’on voit est en fait une reconstitution qui a tout de même conservé environ 1100 tuyaux du XVIIème siècle. Les sommiers ont été remplacés et ceux d’origine sont conservés dans la tribune, témoins précieux du travail de l’époque.
En 1963, l ‘orgue a besoin à nouveau d’une restauration urgente. On fait appel au meilleur facteur d’orgue de l’époque, Alfred Kern de Strasbourg.
Fait unique en France, le buffet a conservé les teintes d’origine et ses volets sont toujours en place depuis le XVIIème siècle. Ils sont en toiles peintes tendues sur des châssis articulés. Le double buffet est de style Louis XIV mais tendance méridionale, avec des dorures.
Avant que la maison Daublaine et Callinet ne le restaure, l’orgue comprenait trois claviers de cinquante notes.